Año 1964, iglesia de San Nicolás en el Bronx (Nueva York). El Padre Flynn, un brillante y carismático sacerdote, intenta desafiar las estrictas reglas del colegio que la Hermana Luisa Beauvier lleva custodiando desde hace años con mano de hierro como directora de la institución. Los cambios políticos están llegando a todos los estratos de la sociedad y la escuela acaba de aceptar a Donald Miller, su primer estudiante negro.